Skip to content

An useful tool to submit your VASP job on HPC, manage your jobs and extract eneries...自动化VASP任务提交、计算结果提取,任务文件管理的工具

Notifications You must be signed in to change notification settings

B-C-WANG/VaspStudio

Repository files navigation

VaspStudio

简介

Vasp任务提交和管理、数据提取和结构可视化软件
功能:

  • 以Material Studio的.xsd文件建立项目,配置Vasp任务提交文件,自动转POSCAR,自动批量配置和生成INCAR,KPOINTS等文件,自动ssh登录,sftp上传,运行超算任务提交脚本
  • 无需下载OUTCAR等,远程直接提取能量、频率和优化RMS数值,快速查看CONTCAR输出结构,导出优化结构到原始.xsd文件,无缝实现连续任务提交
  • 丰富的文件Mark系统,包括是否收敛,是否有虚频,支持自定义标记
  • 支持打开超算Vasp运行嵌套目录,对每个Vasp计算结果文件夹进行信息提取
  • 简单的数据库功能
  • 更多功能查看使用教程和更新日志

软件截图

安装

不提供编译的exe文件版本,而是提供一个能够运行VaspStudio中Python文件的完整Python环境。下载release中的VaspStudioRuntimePythonEnv,放入根目录,运行runVaspStudio.bat

功能简述和更新日志

2019年12月14日 v0.3-preview

功能

  • 打包所有源代码文件,优化目录结构
  • 增加wxDragon打开OUTCAR文件(需要将wxDragon放入运行环境中wxDragon文件夹下)
  • 美化UI
  • 增加导出CONTCAR结构到xsd文件功能,无需本地xsd文件
  • 增加简单的数据库功能,从规定了Key的data.pkl文件中读取信息建立数据库,具备分子绘制,简单的搜索等功能
  • 增加从远程目录建立项目的功能,会将同时有OUTCAR,CONTCAR和POSCAR的文件夹作为一个项目
  • 增加本地项目通过文件路径和远程服务器项目关联,任务提交后自动关联,修改本地关联和远程关联相关状态,推荐优先使用远程关联避免下载Vasp输出文件夹
  • 本地和远程能量、RMS和频率信息改为同时提取,status优先由虚频是否数量合理决定,其次是RMS是否收敛。 远程提取能量RMS和频率通过下载OUTCAR读取再删除实现,将CONTCAR和POSCAR缓存用于结构展示
  • 增加配置文件导入和导出功能,同时在Resource文件夹中增加了示例和模板配置
  • 增加右键打开本地项目(.xsd文件)所在文件夹的功能
  • 增加能量色阶,结构导出Match State的颜色
  • UI界面优化
  • 优化分子3D结构绘制功能

开发相关

  • 对项目文件进行了整理,如.ui放入UI文件夹,脚本放入script等,将与数据提取相关的放入VaspDataTools中,工具放入utils中
  • 将重复调用的代码封装成函数精简,大量增加类型声明,将from XXX import XXX全部改为import XXX as
  • 取消pyinstaller安装,直接放一个可用的安装好所有所需模块的Python在根目录然后使用一个脚本来运行

debug

  • 优化大量item选择时卡顿的问题:由提取所有选择item的信息改为只提取所选第一个item的信息

2018年12月6日 v0.22

  • 更新到master,原v0.21版本在branch:v0.21-stable
  • 增加了使用mayavi进行分子绘制的功能,双击某列即可看到原子结构
  • 将Project Information 更新为Settings,并可以在Settings处通过修改文本文件更改分子绘制的参数

2018年11月23日 v0.21

  • 增加文件树折叠存储
  • 修改收敛的导出结构的颜色,避免和收敛状态颜色相同
  • 减少了不必要的窗口弹出
  • Job Config新增复制功能

2018年9月23日 v0.201

  • 从VASP提取能量对于某些情况下会出现错误,主要是energy without entropy的定位问题

2018年6月30日

  • 更新中英文文档

2018年6月24日 v0.2

  • 项目从DFT_Calc/pyqt5program/AUTOVASP中公开,版本v0.2,增加GUI。

2018年5月前 v0.1

  • 无GUI界面的任务提交脚本

About

An useful tool to submit your VASP job on HPC, manage your jobs and extract eneries...自动化VASP任务提交、计算结果提取,任务文件管理的工具

Topics

Resources

Stars

Watchers

Forks

Packages

No packages published